Биохемија протеина и нуклеинских киселина   (401B2)

Школска година:

2024/2025.

Услови похађања:

101M2 + 301B2

ЕСПБ:

12

Врста студија:

основне академске студије

Студијски програм:

Биохемија: 2. година, зимски семестар, обавезни, научно-стручни предмет

Наставник:

др Наталија Ђ. Половић
редовни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадници:

др Јелица Р. Милошевић
асистент са докторатом, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Наталија С. Андрејевић, мастер биохемичар
истраживач-приправник, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Фонд часова:

Недељно: четири часа предавања + један час теоријских вежби + шест часова лабораторијских вежби (4+1+6)

Циљеви:

Циљ курса је да пружи студенту основна знања о структури и функцији протеина и нуклеинских киселина. Студенти треба да спознају однос између структуре и функције протеина и нуклеинских киселина. Овај курс представља основ за праћење наредних курсева из биохемије и молекуларне биологије. Студенти ће се упознати са основним техникама и методама за изоловање и карактерисање протеина и нуклеинских киселина и стећи ће основне вештине за рад у биохемијској лабораторији.

Исход:

Разумевање структуре протеина и нуклеинских киселина односа структуре и активности протеина и односа протеина и нуклеинких киселина на нивоу основних студија. Савладавање основних вештина за рад у биохемијској лабораторији и стицање првих представа о експерименталном раду са протеинима и нуклеинским киселинама.

Облици наставе:

Предавања, теоријске вежбе, лабораторијске вежбе, колоквијуми, семинарски радови.

Ваннаставне активности:

—

Литература:

Основна литература:

1. Наталија Половић: Основе биохемије, 2021. ISBN: 978-86-7220-106-2
2. Весна Никетић: Принципи структуре и активности протеина
3. Наталија Половић, Јелица Милошевић: Практикум
4. D. Voet, J. Voet: Biochemistry, 2011.

Помоћна литература:

1. Наталија Половић: PPT презентације
2. C. R. Calladine, H. R. Drew: Understanding DNA
3. D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry

Додатни материјал:

—

Предавања:

2 поена (4 часа недељно)

Програм рада:

1. Увод. Однос протеина и нуклеинских киселина.
2. Аминокиселине.
3. Пептидна веза.
4. Методологија рада са протеинима.
5. Примарна структура протеина; пост-транслационе модификације протеина; еволуција (историја) протеина.
6. Секундарна структура протеина. Фибрилни протеини.
7. Терцијарна структура глобуралних протеина (конформациона стабилност; суперсекундарне структуре и домени).
8. Конформациони прелази протеина. Флексибилност и динамика структуре протеина.
9. Проблем увијања протеина. Предвиђање структуре протеина. Кватернарна структура протеина.
10. Активност протеина: протеин-лиганд интеракције у равнотежи (зависни и независни центри). Регулација биолошке активности: кооперативни ефекат на примеру хемоглобина.
11. Нуклеинске киселине: структура и динамика. Хемијска структура нуклеинских киселина.
12. Особине база, нуклеозида и нуклеотида. Конформациона анализа и силе које одређују структуру нуклеинских киселина.
13. Стандардна (канонска) структура ДНК и структура која зависи од секвенце база. Конформациони прелази ДНК.
14. Интеракције ДНК са лигандима. Терцијарна структура РНК. РНК-протеин интеракције.
15. Испитивање нуклеинских киселина: одређивање секвенце, секундарне и терцијерне структуре ДНК и РНК. Геном.

Теоријске вежбе:

3 поена (1 час недељно)

Програм рада:

Теоријске вежбе обухватају следеће целине:

1. Правила рада у биохемијској лабораторији.
2. Пуфери у биохемији.
3. Методологија рада са биомолекулима.
4. Обрада експерименталних података.
5. Коришћење база података.

Лабораторијске вежбе:

15 поена (6 часова недељно)

Програм рада:

Лабораторијске вежбе обухватају следеће целине:

1. Особине и аналитика аминокиселина.
2. Испитивање растворљивости протеина.
3. Аналитика протеина.
4. Испитивање стабилности протеина.
5. Испитивање протеин-лиганд интеракција.
6. Изоловање и испитивање стабилности нуклеинских киселина.

Колоквијуми:

20 поена

Писмени испит:

30 поена

Усмени испит:

30 поена