Biohemija proteina i nukleinskih kiselina   (401B2)

Školska godina:

2024/2025.

Uslovi pohađanja:

101M2 + 301B2

ESPB:

12

Vrsta studija:

osnovne akademske studije

Studijski program:

Biohemija: 2. godina, zimski semestar, obavezni, naučno-stručni predmet

Nastavnik:

dr Natalija Đ. Polović
redovni profesor, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd

Saradnici:

dr Jelica R. Milošević
asistent sa doktoratom, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd

Natalija S. Andrejević, master biohemičar
istraživač-pripravnik, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd

Fond časova:

Nedeljno: četiri časa predavanja + jedan čas teorijskih vežbi + šest časova laboratorijskih vežbi (4+1+6)

Ciljevi:

Cilj kursa je da pruži studentu osnovna znanja o strukturi i funkciji proteina i nukleinskih kiselina. Studenti treba da spoznaju odnos između strukture i funkcije proteina i nukleinskih kiselina. Ovaj kurs predstavlja osnov za praćenje narednih kurseva iz biohemije i molekularne biologije. Studenti će se upoznati sa osnovnim tehnikama i metodama za izolovanje i karakterisanje proteina i nukleinskih kiselina i steći će osnovne veštine za rad u biohemijskoj laboratoriji.

Ishod:

Razumevanje strukture proteina i nukleinskih kiselina odnosa strukture i aktivnosti proteina i odnosa proteina i nukleinkih kiselina na nivou osnovnih studija. Savladavanje osnovnih veština za rad u biohemijskoj laboratoriji i sticanje prvih predstava o eksperimentalnom radu sa proteinima i nukleinskim kiselinama.

Oblici nastave:

Predavanja, teorijske vežbe, laboratorijske vežbe, kolokvijumi, seminarski radovi.

Vannastavne aktivnosti:

—

Literatura:

Osnovna literatura:

1. Natalija Polović: Osnove biohemije, 2021. ISBN: 978-86-7220-106-2
2. Vesna Niketić: Principi strukture i aktivnosti proteina
3. Natalija Polović, Jelica Milošević: Praktikum
4. D. Voet, J. Voet: Biochemistry, 2011.

Pomoćna literatura:

1. Natalija Polović: PPT prezentacije
2. C. R. Calladine, H. R. Drew: Understanding DNA
3. D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry

Dodatni materijal:

—

Predavanja:

2 poena (4 časa nedeljno)

Program rada:

1. Uvod. Odnos proteina i nukleinskih kiselina.
2. Aminokiseline.
3. Peptidna veza.
4. Metodologija rada sa proteinima.
5. Primarna struktura proteina; post-translacione modifikacije proteina; evolucija (istorija) proteina.
6. Sekundarna struktura proteina. Fibrilni proteini.
7. Tercijarna struktura globuralnih proteina (konformaciona stabilnost; supersekundarne strukture i domeni).
8. Konformacioni prelazi proteina. Fleksibilnost i dinamika strukture proteina.
9. Problem uvijanja proteina. Predviđanje strukture proteina. Kvaternarna struktura proteina.
10. Aktivnost proteina: protein-ligand interakcije u ravnoteži (zavisni i nezavisni centri). Regulacija biološke aktivnosti: kooperativni efekat na primeru hemoglobina.
11. Nukleinske kiseline: struktura i dinamika. Hemijska struktura nukleinskih kiselina.
12. Osobine baza, nukleozida i nukleotida. Konformaciona analiza i sile koje određuju strukturu nukleinskih kiselina.
13. Standardna (kanonska) struktura DNK i struktura koja zavisi od sekvence baza. Konformacioni prelazi DNK.
14. Interakcije DNK sa ligandima. Tercijarna struktura RNK. RNK-protein interakcije.
15. Ispitivanje nukleinskih kiselina: određivanje sekvence, sekundarne i tercijerne strukture DNK i RNK. Genom.

Teorijske vežbe:

3 poena (1 čas nedeljno)

Program rada:

Teorijske vežbe obuhvataju sledeće celine:

1. Pravila rada u biohemijskoj laboratoriji.
2. Puferi u biohemiji.
3. Metodologija rada sa biomolekulima.
4. Obrada eksperimentalnih podataka.
5. Korišćenje baza podataka.

Laboratorijske vežbe:

15 poena (6 časova nedeljno)

Program rada:

Laboratorijske vežbe obuhvataju sledeće celine:

1. Osobine i analitika aminokiselina.
2. Ispitivanje rastvorljivosti proteina.
3. Analitika proteina.
4. Ispitivanje stabilnosti proteina.
5. Ispitivanje protein-ligand interakcija.
6. Izolovanje i ispitivanje stabilnosti nukleinskih kiselina.

Kolokvijumi:

20 poena

Pismeni ispit:

30 poena

Usmeni ispit:

30 poena