Шифра предмета:
457B1		 Назив предмета:
Протеински инжењеринг

Школска година:

2019/2020.

Услови похађања:

Нема услова.

ЕСПБ:

4

Врста студија:

мастер академске студије

Студијски програм:

Биохемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E51B1), стручно-апликативни предмет

Наставник:

др Радивоје М. Продановић
редовни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадник:

др Ана Марија Ј. Балаж
истраживач-приправник, Институт за хемију, технологију и металургију, Његошева 12, Београд

Фонд часова:

Недељно: два часа предавања + два часа лабораторијских вежби (2+0+2)

Циљеви:

Циљ курса је упознавање студената са савременим методама дизајна и инжињеринга протеинске структуре и функције.

Исход:

Овладавање теоријским и експерименталним методама за дизајн и инжињеринг протеинских молекула.

Облици наставе:

Предавања, семинарски радови, лабораторијске вежбе.

Ваннаставне активности:

—

Литература:
  • Sheldon J. Park, Jennifer R. Cochran: Protein Engineering and Design, CRC Press 2010.
  • S. Brakmann, K. Johnsson: Directed Molecular Evolution of Proteins, WILEY-VCH 2002.
  • Одабрани ревијални радови

Додатни материјал:

—

  Наставне обавезе и начин оцењивања

Предавања:

10 поена (2 часа недељно)

Програм рада:

  1. Теорије еволуције протеина и in silico дизајн протеина.
  2. In vitro еволуција протеина - принципи и проблеми.
  3. Експресија протеина на површини фага, рибозома и ћелија у протеинском инжињерингу.
  4. Експресија протеина in vitro транслационим системима у протеинском инжињерингу.
  5. Креирање библиотека гена - дупликација гена, циркуларна пермутација, фузија гена, комбиновање егзона, тачкасте мутације, рекомбинација.
  6. Стабилизација структуре протеина комбинаторном консензус мутагенезом.
  7. Дизајн метода претраживања библиотека гена - принципи и проблеми.
  8. Биоинформатичке методе анализе повезаности протеинске секвенце и функције у протеинском инжињерингу - ПРОСАР.

Лабораторијске вежбе:

20 поена (2 часа недељно)

Програм рада:

  1. Генерисање библиотеке гена сатурационом мутагенезом, рекомбинацијом и error prone PCR-ом.
  2. Трансформација квасца S. cerevisie и експресија протеина на површини ћелија.
  3. Експресија и претраживање библиотеке гена у микротитар плочама.
  4. Eкспресија и претраживање библиотеке гена коришћењем in vitro компартментализације и проточне цитометрије.

Семинарски радови:

20 поена

Усмени испит:

50 поена