Шифра предмета:
404B2		 Назив предмета:
Експериментална биохемија

Школска година:

2024/2025.

Услови похађања:

(001A2 + 029B2) / 401B2

ЕСПБ:

10

Врста студија:

основне академске студије

Студијски програм:

Биохемија: 3. година, зимски семестар, обавезни, стручно-апликативни предмет

Наставници:

др Зоран М. Вујчић
редовни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

др Јелена З. Радосављевић
доцент, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадници:

Алекса Д. Савић, мастер биохемичар
истраживач-приправник, Иновациони центар, Студентски трг 12-16, Београд

Ненад М. Друловић, мастер биохемичар

Фонд часова:

Недељно: три часа предавања + седам часова лабораторијских вежби (3+0+7)

Циљеви:

Да студент научи основне технике: припрему екстракaта протеина и нуклеинских киселина, одређивање њихових концентрација. Основне и ХПЛЦ хроматографске технике и електрофорезe. Самостална обрада литературних података.

Исход:

Припрема студената за самостално решавање проблема изоловања протеина, нуклеинских киселина и малих молекула; њихова структурна одређивања и карактеризацију. Оспособљавање за прве кораке у научно-истраживачком раду.

Облици наставе:

Предавања, експерименталне вежбе, туторијал. Јавна одбрана, уз коришћење модерних помагала (ППТ формат).

Ваннаставне активности:

—

Литература:

Основна литература:

  1. R. Reed, D. Holmes, J. Weyers, A. Jones: Practical skills in biomolecular sciences, 2nd edition, Pearson, Prentice Hall, Harlow, 2003.
  2. Зоран Вујчић: Експериментална Биохемија, Практикум, Рантек, 2002.

Помоћна литература:

  1. Robert Scopes: Protein purification, 2000.
  2. D. M. Bollag, D. M. Rozycki, S. J. Edelstein: Protein methods, John Wiley and Sons, 2002.

Додатни материјал:

—

  Наставне обавезе и начин оцењивања

Предавања:

0 поена (3 часа недељно)

Програм рада:

  1. Припрема и стабилизација сировог екстраката. Стeрилизaцијa цeђeњeм, хaoтрoпи и кoсмoтрoпи, пуфeри.
  2. Биoсeнзoри, аптaмeри. Одрeђивaњe мoлeкулских мaсa прoтeинa.
  3. Рaсoљaвaњe и кoнцeнтрoвaњe прoтeинa. Kвaнтификaцијa прoтeинa.
  4. Пречишћавање протеина: тaлoжнe и хрoмaтoгрaфске мeтoдe.
  5. Joнoизмeњивaчкa и афинитетна хрoмaтoгрaфијa прoтeинa.
  6. Joнoизмeњивaчкa и афинитетна хрoмaтoгрaфијa прoтeинa. 
  7. ЕБА, ХИЦ, ИМАЦ.
  8. ФПЛЦ хрoмaтoгрaфијa прoтeинa.
  9. Елeктрoфoрeзe и изoeлeктричнo фoкусирaњe (ИПГ).
  10. Бoјeња, зимoгрaми. Пeптидне мaпе. Хeмијскe мoдификaцијe прoтeинa.
  11. Tрaнсфeр и детекција прoтeинa нa мeмбрaнама. Афинитeтнa eлeктрoфoрeзa. 2Д eлeктрoфoрeтскe тeхникe.
  12. Прeпaрaтивнe eлeктрoфoрeзe. Kaпилaрнa eлeктрoфoрeзa.
  13. Прoтeoмикс - основи. Сeквeнцирaњe прoтeинa. MАЛДИ TOФ. БЛАСT.
  14. Изoлoвaњe, квантификација и методе рекомбинантне ДНА. ПЦР. Eкспрeсијa и прeчишћaвaњe рeкoмбинaнтних прoтeинa.
  15. Сeквeнцирaњe НК.

Лабораторијске вежбе:

10 поена (7 часова недељно)

Програм рада:

Вежбама се приступа након положеног улазног колоквијума. Уколико студент не положи улазни колоквијум и оствари минимално 51% од укупног броја поена има право да полаже још једном улазни колоквијум.

Вежбе се раде у блоку од 10 радних дана.

1-2. Припремање екстракта, одређивање концентрације протеина.

3-4. Таложне методе.

5-6. Припрема матрикса, паковање колона. Одређивање молекулске масе обојеног ензима (ХРПО).

7-10. Јоноизмењивачка, хидрофобна ИМАЦ, ФПЛЦ: супередекс, хидрофобна, Моно Q.

10-12. Електрофорезе: нативна, изоелектрично фокусирање, СДС ПАГЕ, УТ електрофореза, 2Д електрофореза.

13-14. ДНА. Изоловање, квантификација, анализа. Рестрикциона дигестија. Агарозна електрофореза.

14-15. РНА. Изоловање, квантификација, анализа.

Писмени испит:

30 поена

Усмени испит:

40 поена

Туторијал:

20 поена