Шифра предмета:
258B2		 Назив предмета:
Увод у метаболомику

Школска година:

2024/2025.

Услови похађања:

Нема услова.

ЕСПБ:

4

Врста студија:

мастер академске студије

Студијски програм:

Биохемија: 1. година, зимски семестар, изборни (E52B2), стручно-апликативни предмет

Наставници:

др Дејан М. Гођевац
научни саветник, Институт за хемију, технологију и металургију, Његошева 12, Београд

др Љубодраг В. Вујисић
ванредни професор, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Сарадници:

др Гордана Б. Крстић
доцент, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

др Ивана В. Софренић
доцент, Хемијски факултет, Студентски трг 12-16, Београд

Фонд часова:

Недељно: два часа предавања + два часа лабораторијских вежби (2+0+2)

Циљеви:

Циљ овог предмета је да упозна студенте са дефиницијом и основним принципима метаболомике. Желимо да студенти савладају основне премисе при поставци експеримента, узорковања и припреме узорака за различите аналитичке платформе. Студенти ће бити упознати са основама мултиваријантне анализе података, у циљу интерпретације добијених резултата.

Исход:

Након завршетка курса студенти ће бити оспособљени да:

  • разумеју циљ метаболомике као мултидисциплинарне науке;
  • спроводе поступке узорковања и припреме узорака за анализу;
  • разумеју основни концепт аналитичких платформи (хроматографија, масена спектрометрија и NMR) које се користе за метаболомику;
  • разумеју основе мултиваријантне анализе података у метаболомици.

Облици наставе:

Предавања, лабораторијске вежбе, домаћи радови, семинарски радови, колоквијуми.

Ваннаставне активности:

Предавања гостујућих предавача.

Литература:
  1. Silas G. Villas-Boas, Ute Roessner, Michael A. E. Hansen, Jorn Smedsgaard, Jens Nielsen: Metabolome analysis - an introduction, John Wiley & Sons, Inc.
  2. Multi- and Megavariate Data Analysis, Part I: Basic Principles and Applications, Umetrics AB

Додатни материјал:

—

  Наставне обавезе и начин оцењивања

Предавања:

0 поена (2 часа недељно)

Програм рада:

  1. Метаболомика као мултидисциплинарна наука.
  2. Место метаболомике у системској биологији - холистички приступ у научним истраживањима.
  3. Примарни и секундарни метаболити - разноликост структура и физичко-хемијских особина.
  4. Узорковање - "квенчовање" ћелијског метаболизма.
  5. Технике одвајања малих молекула од макромолекула.
  6. Одабир аналитичке платформе.
  7. Припрема узорака за GC-MS анализу - технике дериватизације и ињектовања.
  8. Припрема узорака за LC-MS анализу - екстракција на чврстој фази.
  9. Одређивање структуре метаболита на основу GC-MS и LC-MS података.
  10. Одређивање структуре метаболита у смеши техникама NMR спектроскопије.
  11. Препроцесирање података за мултиваријантну анализу.
  12. Основне методе мултиваријантне анализе података у метаболомици - PCA, OPLS, OPLS-DA.

Лабораторијске вежбе:

20 поена (2 часа недељно)

Програм рада:

  1. Узорковање - "квенчовање" ћелијског метаболизма.
  2. Екстракције и припреме узорака за анализе на различитим платформама.
  3. Дериватизација узорака и подешавање услова снимања на GC-MS уређају.
  4. Одређивање структуре метаболита на основу GC-MS података.
  5. Подешавање услова снимања на LC-MS уређају.
  6. Одређивање структуре метаболита на основу LC-MS података.
  7. Подешавање услова снимања 1H NMR спектра.
  8. Подешавање услова снимања 1H NMR спектра са супресијом сигнала растварача.
  9. Мултиваријантна анализа података са хроматографских и спектроскопских техника.

Семинарски радови:

20 поена

Колоквијуми:

10 поена

Усмени испит:

50 поена