Šifra predmeta:
1235H
Naziv predmeta:
Osnovi molekulskog modelovanja i hemijska informatika

Školska godina:

2012/2013.

Uslovi pohađanja:

1201A + 1202A

ESPB:

8

Vrsta studija:

osnovne akademske studije

Studijski program:

Hemija: 4. godina, zimski semestar, izborni (1IP4H), naučno-stručni predmet

Nastavnik:

dr Mario V. Zlatović
redovni profesor, Hemijski fakultet, Studentski trg 12-16, Beograd

Saradnici:

Fond časova:

Nedeljno: četiri časa predavanja + četiri časa laboratorijskih vežbi (4+0+4)

Ciljevi:

Ovaj kurs obrađuje najnovije oblasti i računarske alate u medicinskoj hemiji, bioinformatici i heminformatici.

Ishod:

Po završetku ovog kursa studenti treba da budu osposobljeni za rad u okviru savremenih istraživačkih timova u oblasti medicinske hemije, hemije proteina, nanotehnologije itd, i spremni da na osnovu stečenog znanja donose kompetentne odluke o tokovima istraživanja. U okviru vežbi polaznici kursa će se upoznati i savladati osnovne module programskog paketa Schrödinger Suite 2012 (Schrödinger, LLC, 2012, http://www.schrodinger.com/)

Oblici nastave:

Predavanja, teorijske vežbe, seminarski rad(ovi).

Vannastavne aktivnosti:

Literatura:

Osnovna literatura:

  • Höltje, Sippl, Rognan, Folkers: Molecular Modeling: basic principles and applications, Wiley-VCH, 2003.

Pomoćna literatura:

  • Tekući radovi i dodatni materijal, uputstva i primeri iz paketa Schrödinger Suite 2012 (Schrödinger, LLC, 2012, http://www.schrodinger.com/)

Dodatni materijal:

  Nastavne obaveze i način ocenjivanja

Predavanja:

5 poena (4 časa nedeljno)

Program rada:

Molekulsko modelovanje, struktura i modelovanje proteina, dizajn lekova na osnovu strukture, dizajn lekova na osnovu farmakofornog modela, QSAR, sinteza i dizajn biblioteka, peptidomimetika, ADME osobine i predviđanja, heminformatika, opšte teme.

Laboratorijske vežbe:

10 poena (4 časa nedeljno)

Program rada:

Geometrija molekula i stereohemija, 3D analiza, struktura i modelovanje proteina, principi racionalnog dizajna lekova, dizajn lekova na osnovu strukture, dizajn lekova na osnovu farmakofornog modela, QSAR, sinteza i dizajn biblioteka, peptidomimetika, ADME osobine i predviđanja, 3D pretraga baza podataka, razvoh fiziološki aktivnih jedinjenja.

Seminarski radovi:

15 poena

Kolokvijumi:

20 poena

Domaći zadaci:

10 poena

Pismeni ispit:

40 poena