Циљ предмета:

Рачунарска хемија је постала веома значајна област хемије, а са даљим развојем рачунара постаје све значајнија. Применом рачунара могу се решити многа питања и проблеми који се никако не могу решити експериметалним методама, a до великог броја података и решења се много брже и јефтиније долази коришћењем рачунара.

Исход предмета:

Студенти у оквиру овог предмета треба да науче: различите рачунарске методе за молекулско моделовање, шта је хемијска информатика и који проблеми у хемији се могу решити коришћењем информатичког приступа.

Садржај предмета:

Теоријска настава

– Предавања

1. Појам рачунарске хемије. Историја информатике.
2. Програмски језици.
3. Рачунарске методе у хемији.
4. Молекулска механика - функције потенцијалне енергије.
5. Молекулска механика - поље сила.
6. Израчунавање геометрије молекула, оптимизација геометрије.
7. Методе засноване на квантној механици.
8. Ab initio методе.
9. DFT методе.
10. Поређење Ab initio и DFT метода.
11. Конформациона анализа.
12. Молекулска динамика.
13. Молекулско препознавање, површина електростатичког потенцијала.
14. Хемијска информатика.
15. Повезивање структуре молекула и понашања супстанци.

– Теоријске вежбе

Молекулска механика, методологија молекулске механике, функције потенцијалне енергије, алгоритми оптимизације, оптмизације геометрије већег број молекула, конформациона анализа различитих молекула. Ab initio методе, примена програма који се заснивају на аb initio методама. DFT методе и одговарајући програми. Примена аb initio и DFT метода за решавање проблема у хемији. Основи програмирања, алгоритам, писање програма којима се решавају неки проблеми у хемији. Коришћење метода хемијске информатике. Коришћење банки података.

Литература:

• Andrew R. Leach: Molecular Modeling - principles and applications

Методе извођења наставе:

Предавања, теоријскe/рачунске вежбе.