Студијски програм: Биохемија
Врста и ниво студија: основне академске студије
Назив предмета: Бионеорганска хемија Шифра: 141B1
Наставник: др Милица Р. Миленковић
Статус предмета: изборни
Број ЕСПБ: 6
Услов: 102B1

Циљ предмета:

Током овог курса студенти се упознају са основама бионеорганске хемије, медицинске хемије и биомиметичке хемије, са посебним нагласком на механизме ензимских реакција.

Исход предмета:

Студент ће савладати основе бионеорганске хемије.

Садржај предмета:

Теоријска настава

1. Увод у улогу метала у биохемијским процесима (улога јона и комплекса метала у метаболизму, примена комплекса метала у медицини, токсичност метала и њихових једињења). Биолиганди протеинског типа (аминокиселине као лиганди). Биолиганди непротеинског типа, макроцикли: хем, хлорин, коррин.  Распрострањеност биоелемената у људском телу и њихов значај. Основи координационе хемије неопходни за разумевање процеса у биолошким системима. Основи ензимске катализе. Експерименталне методе за изучавање механизама ензимских реакција.

2. Улога јона алкалних метала у организму (јонски канали, јонске пумпе, мембрански потенцијал, нервни импулс, јонофоре)

3. Улога јона земноалкалних метала у организму (скелет, мишићна контракција, Ca2+-улога у сигналној трансдукцији, енолаза, киназе (хексокиназа), DNA и RNA полимеразе, рестрикциони ензими, хлорофил, калмодулин)

4. Азот-моноксид и његова улога у физиолошким и патолошким стањима. NO синтаза.

5. Ензими који садрже цинк - механизми реакција (карбоанхидраза, карбоксипептидаза А, алдолаза класа II, аденозин-деаминаза, алкохол-дехидрогеназа, алкална фосфатаза, љубичаста кисела фосфатаза, Cu/Zn супероксид-дисмутаза). Цинк-структурна улога (цинков прст).

6. Механизми уноса и транспорта гвожђа у ћелије еукариота и прокариота. Tрансферин (Tf). Aктивни центар Fe (III)Tf. Сидерофоре. Феритин. Улога гвожђа у транспорту кисеоника - хемоглобин, миоглобин, хемеритин. Ензими који садрже гвожђе - механизми реакција (рибонуклетид редуктаза класа I, Fe супероксид-дисмутаза, аконитаза, лизин 2,3-аминомутаза, хем зависне монооксигеназе, диоксигеназе зависне од α-кетокиселина). Гвожђе-сумпор кластери. Улога протеина који садрже гвожђе у електрон-транспортном ланцу митохондрија.

7. Тип I, II и III бакар протеина (пластоцијанин, галактоза-оксидаза, хемоцијанин, тирозиназа, катехол-оксидаза, полинуклеарне бакар оксидазе, цитохром ц оксидаза).

8. Ензими који садрже никл: нередокс ензими (уреаза, ациредуктон дехидрогеназа и глиоксалаза I) и редокс ензими (хидрогеназа, CO дехидрогеназа, ацетил-CoA синтаза, метил-CoA редуктаза, Ni супероксид-дисмутаза).

9. Витамин B12. Ензими који садрже кобалт (метилмалонил-CoA мутаза, рибонуклеотид-редуктаза класа II).

10. Ензими који садрже молибден и волфрам. Ксантин-оксидаза. Сулфит-оксидаза. Диметилсулфоксид-редуктаза. Нитрогеназа.

11.Ензими који садрже манган: нередокс ензими (аргиназа) и редокс ензими (каталаза, Mn супероксид-дисмутаза, OEC (oxygen evolving complex)).

12. Ензимски модели.

13. Откриће лекова, њихово дизајнирање и развој. Реверзибилни ензимски инхибитори. Иреверзибилни ензимски инхибитори. Лекови који делују на DNA-антитуморски и антивирусни лекови. Фармакокинетика. QSAR. Рачунари у медицинској хемији. Антибактеријски и антифунгални агенси. Рационални приступ дизајнирању лекова.

14. Циљеви и принципи медицинске неорганске хемије. Стратегија у дизајнирању лекова на бази једињења метала. Комплекси платине као антитуморски агенси. Цисплатин (историјат открића, механизам дејства, аналози цисплатина). Комплекси паладијума, рутенијума, галијума и злата као антитуморски агенси. Механизми антитуморског дејства комплекса метала. Комплекси метала у MRI дијагностици. Биолошка активност органометалних једињења (фероцен и други металоцени). Хелирајући агенси (Deferoxamine, Deferasirox, Clioquinol). Јони метала и неуродегенеративне болести.

Практична настава

Синтеза комплекса прелазних метала са потенцијално биоактивним лигандима. Преглед литературе, синтеза, карактеризација (спектроскопске методе, магнетна мерења), испитивање биолошке активности.

 

Литература:

1. Ivano Bertini, Harry B. Gray, Edward I. Stiefel, Joan Selverstone Valentine, Biological Inorganic Chemistry, Structure and Reactivity, University Science Books, 2007.

2. Robert R. Crichton, Biological Inorganic Chemistry, A New Introduction to Molecular Structure and Function, Elsevier, 2012.

3. Wolfgang Kaim, Brigitte Schwederski, Axel Klein, Bioinorganic Chemistry: Inorganic Elements in the Chemistry of Life, An Introduction and Guide, Wiley, 2013.

4. Nils Metzler-Nolte, Ulrich Schatzschneider, Bioinorganic Chemistry, A practical course, Walter de Gruyter, 2009.

5. Joseph. J. Stephanos, Anthony W. Addison, Chemistry of Metalloproteins, Problems and Solutions in Bioinorganic Chemistry, Wiley, 2014.

6. Hermann Dugas, Bioorganic Chemistry, Springer, 1996.

7. Душан Сладић, Биоорганска хемија. Механизми ензимских реакција

8. Richard B. Silverman, The Organic Chemistry of Enzyme-Catalyzed Reactions, Academic Press, 2000.

9. Gareth Thomas, Medicinal Chemistry: An Introduction, Wiley, 2007.

10. Graham L. Patrick: An Introduction to Medicinal Chemistry, Oxford University Press, 2013.

11. Donald Voet, Judith G. Voet, Biochemistry, 4th Edition, Wiley, 2011.

Помоћна литература

актуелни ревијални и научни радови из дате области

Број часова активне наставе (недељно): Предавања: 4 Теоријске вежбе: 0 ДОН (лаб. вежбе): 2 Студ. истраж. рад: 0

Методе извођења наставе:

Предавања, консултативна настава, семинарски радови, експерименталне вежбе.

Оцена знања (укупно 100 поена)
Предиспитне обавезе Поена Завршни испит Поена
Предавања: 0 Писмени испит: 50
Лабораторијске вежбе: 10    
Семинарски радови: 30    
Колоквијуми: 10